凈化工程空氣除菌錯失有以下幾種：
（一）、熱滅菌法
空氣在進(jìn)入培養(yǎng)系統(tǒng)之前，一般均需用壓縮機(jī)壓縮，提高壓力，空氣經(jīng)壓縮后溫度能夠升到200℃以上，保持一定時間后，便可實現(xiàn)干熱殺菌。
（二）、輻射滅菌
輻射滅菌的原理是α射線、X射線、β射線、γ射線、紫外線、超聲波等從理論上講都能破壞蛋白質(zhì)，破壞生物活性物質(zhì)，從而起到殺菌作用。應(yīng)用范圍通常用于無菌室和醫(yī)院手術(shù)室。缺點(diǎn)是殺菌效率較低，殺菌時間較長。一般要結(jié)合甲醛蒸汽等來保證無菌室的無菌程度。
（三）、靜電除菌
近年來一些工廠已使用靜電除塵器除去空氣中的水霧、油霧和塵埃，同時也除去了空氣中的微生物。對Iμm的微粒去除率達(dá)99％，消耗能量小，每處理1000m3的空氣每小時只耗電0.4~0.8kW。空氣的壓力損失小，一般僅（3~15）×133.3Pa。但對設(shè)備維護(hù)和安全技術(shù)措施要求較高。
靜電防塵是利用靜電引力來吸附帶電粒子而達(dá)到除塵、除菌的目的。懸浮于空氣中的微生物，其孢子大多帶有不同的電荷，沒有帶電荷的微粒進(jìn)入高壓靜電場時都會被電離變成帶電微粒。但對于一些直徑很小的微粒，它所帶的電荷很小，當(dāng)產(chǎn)生的引力等于或小于氣流對微粒的拖帶力或微粒布朗擴(kuò)散運(yùn)動的動量時，則微粒就不能被吸附而沉降，所以靜電除塵對很小的微粒效率較低。
用靜電除菌凈化空氣有如下優(yōu)點(diǎn)：
（1）阻力小，約1.01325×104Pa；
（2）染菌率低，平均低于10~15％； 
（3）除水、除油的效果好；
（4）耗電少。缺點(diǎn)是設(shè)備龐大，需要采用高壓電技術(shù)，且一次性投資較大；對發(fā)酵工業(yè)來說，—其捕集率尚嫌不夠，需要采取其它措施。
（四）、介質(zhì)過濾除菌法
介質(zhì)過濾除菌法是讓含菌空氣通過過濾介質(zhì)，以阻截空氣中所含微生物，而取得無菌空氣的方法。通過過濾除菌處理的空氣可達(dá)到無菌，并有足夠的壓力和適宜的溫度以供好氧培養(yǎng)過程之用。該法是目前廣泛應(yīng)用來獲得大量無菌空氣的常規(guī)方法。常用的過濾介質(zhì)有棉花；活性炭或玻璃纖維、有機(jī)合成纖維、有機(jī)和無機(jī)燒結(jié)材料等。由于被過濾的氣溶膠中微生物的粒子很小，一般只有0.5~2μm，而過濾介質(zhì)的材料一般孔徑都大于微粒直徑幾倍到幾十倍，因此過濾機(jī)理比較復(fù)雜。
隨著工業(yè)的發(fā)展，過濾介質(zhì)逐漸由天然材料棉花過渡到玻璃纖維、超細(xì)玻璃纖維和石棉板、燒結(jié)材料（燒結(jié)金屬、燒結(jié)陶瓷、燒結(jié)塑料）、微孔超濾膜等。而且過濾器的形式也在不斷發(fā)生變化，出現(xiàn)了一些新的形式和新的結(jié)構(gòu)，把發(fā)酵工業(yè)中的染菌控制在極小的范圍。