潔凈室檢測是潔凈室施工完成后交由業主使用前的一個非常必要的環節，潔凈室的檢測是否達標將直接影響到潔凈室的是否符合生產要求。
根據IES－RP－CC006．2潔凈室測試的標準，潔凈室的工作狀態分為空態、靜態和動態三種，測試方式取決于潔凈室設計的類型和潔凈室所處的工作狀態。
1、潔凈室的工作狀態：
在潔凈室的建造合同中通常只了基本的空態測試，而靜態和動態測試常常因為緊張的工期而被遺漏。但仍建議承建商和業主在靜態和動態條件下都對潔凈室進行測試。這將確保潔凈室的建造符合設計要求。靜態和動態兩種不同條件下測試結果的對比將對分析潔凈室所存在的問題提供很有效的幫助。例如：在靜態條件下潔凈度達標而到了動態條件下卻超標。這可能是因為糟糕的潔凈室管理：安裝機器時不規范的清潔，不恰當的清潔程序，不嚴格的紀律管理，不正確的機器放置位置（擋住了回風口或阻斷了過濾器的送風）等。因此，建議在空態和動態時都要對潔凈室進行測試。
2、潔凈室測試標準和慣例：
所有的潔凈室測試基本上都是基于認可的標準（如ISO14644－1；IEST－RP－CC006．2；NEBB手冊和已被終止的FS－209E）。這些標準和慣例對潔凈室的測試和認證提供了基本的指導。而事實上，潔凈室的業主和承建商因產品、工藝的要求而對潔凈室的技術指標，測試方式和驗收標準有相對于上述標準不同的協議。因此，大多數的驗收標準是由潔凈室的業主和承建商通過協商，并參考專業潔凈室測試認證公司的建議而達成的協議。由于獨立的第三方測試認證公司通常能對于潔凈室的測試提出適合的方案，因此建議業主和承建商在開始討論潔凈室的各種技術參數，測試方式和驗收標準時就邀請測試認證公司參與。在對有關參數或標準產生分歧時，測試認證公司將以自己的專業知識在業主和承建商之間起到調解的作用。
3、測試項目的選擇：
潔凈室測試項目包括過濾器風速有其均勻性、過濾器安裝檢漏、壓差、氣流平行度、潔凈度、噪聲、光照度、濕／溫度等等。這些是基本的測試項目，它包括了主要的和輔助的測試項目。這些項目應于潔凈室初設計的標準和參數相一致，測試認證應在潔凈室移交業主前完成。
所有測試項目中有4個主要項目（過濾器風速及其均勻性、過濾器安裝檢漏、壓差和潔凈度）是重要和基本的。在設備進入潔凈室前必須完成。其它的一些輔助測試項目如氣流平行度（只適用于單向流潔凈室）、溫、濕度、光照度、噪聲也需要完成，因為它們與潔凈室中空氣的運動和環境參數有關。所以至少在動態條件下需要做以上這些輔助測試。